全域土地综合整治实施方案的工作流程需遵循“规划引领、系统统筹、分级管理、全程监管”原则，结合国家政策要求与地方实践，一般分为以下六个阶段，具体流程及核心要点如下：

一、前期准备与潜力评估阶段

区域划定与基础调查

实施单元划分：以乡镇或跨乡镇为单元（优先选择整治需求迫切、群众基础好的区域），顺利获得国土变更调查、土壤质量评估、生态本底分析等，识别耕地碎片化、建设用地低效等问题。

负面清单筛查：排除违背农民意愿、破坏生态红线、变相占用永久基本农田等情形，确保整治方向合规。

潜力分析与目标确定

多维度潜力评估：包括农用地整治潜力（耕地集中连片）、建设用地整理潜力（低效用地盘活）、生态修复潜力（水土流失治理）等。

目标量化：明确新增耕地面积（不低于原耕地5%）、建设用地减少量、生态修复面积等核心指标。

二、方案编制与审批阶段

实施方案编制

内容框架：涵盖整治目标、子项目清单（农用地整理、建设用地复垦、生态修复等）、资金平衡方案、权属调整计划、实施时序等。

规划衔接：与国土空间规划、“三区三线”调整方案同步编制，确保耕地和永久基本农田布局优化符合管控要求。

合规审查与审批

省级联合审查：组织专家对实施方案的科研性、合规性（如耕地占补平衡、生态保护）进行论证，重点审查永久基本农田调整是否超5%。

市级初审：市级自然资源部门对涉及“三区三线”调整的内容进行论证，形成一致性意见后报省级审批。

三、项目立项与资金筹措阶段

子项目立项

分类立项：农用地整理（高标准农田建设）、建设用地整理（宅基地复垦）、生态修复（河道治理）等子项目分别立项，鼓励整体打包审批。

投融资模式：采用“投资人+EPC”“PPP”或财政奖补模式，引入社会资本参与（如河南自然资源投资集团投资5.4亿元整治农田）。

资金保障

多元筹资：整合中央财政奖补、地方配套资金、政策性贷款（如国开行低息贷款）、社会资本等，确保资金覆盖工程成本。

资金监管：设立专项账户，严格审计，防止挪用。

四、项目实施与过程监管阶段

子项目实施

分类推进：农用地整理优先实施补充耕地项目，建设用地整理同步召开拆旧复垦，生态修复注重生物多样性保护。

施工管理：执行项目法人制、招投标制、监理制，定期召开进度检查与质量抽检。

权属调整与公众参与

土地流转与登记：顺利获得互换并地、土地托管等方式集中耕地，完成地籍调查和不动产登记，保障农民权益。

全程公众参与：组织村民会议表决重大事项（如土地调整方案），公示意见并处理异议。

监测监管

动态监测：利用卫星遥感、无人机巡查等技术，实时监控工程进度、耕地“非粮化”及生态修复成效。

问题整改：对违规调整永久基本农田、破坏生态等行为及时叫停并问责。

五、验收与评估阶段

子项目验收

行业验收：农业农村部门验收高标准农田质量，自然资源部门核查新增耕地实测数据，确保“可实测、可追溯”。

数据汇交：更新全国国土空间规划“一张图”系统，纳入永久基本农田数据库。

整体验收与绩效评价

综合审查：核查任务完成率（如耕地增加量、建设用地减少量）、资金使用合规性、档案完整性。

成效评估：省级对整治效果（如耕地质量提升、生态改善）评分，不合格项目限期整改。

六、后期管护与成果应用阶段

工程管护

责任落实：签订3年以上管护协议，明确农田水利设施、生态修复工程的维护主体（村集体或专业公司）。

动态维护：定期巡查并修复损毁设施，确保长期发挥效益。

指标交易与收益分配

建设用地指标入市：节余指标可在省域内交易，收益反哺农村基础设施建设和产业振兴。

资金平衡：政府奖补与社会资本收益分成并行，支持乡村产业导入（如乡村旅游、现代农业）。

关键政策衔接与风险防控

“三区三线”管控：涉及永久基本农田调整的，需同步更新全国国土空间规划数据库，确保布局优化符合管控要求。

负面清单管理：严禁未批先建、破坏古树名木、突破生态保护红线等行为。

资金使用规范：严禁挪用专项资金，确保专款专用。

典型案例参考

河南遂平县：顺利获得“小田并大田”整合36万亩耕地，吸引社会资本5.4亿元，新增耕地用于粮食生产。

厦门市从化区：实施“林耕置换”和“小田变大田”，优化永久基本农田布局，同步开展现代农业。

全域土地综合整治实施方案的工作流程需以**“全要素整合、全流程管控、全主体参与”**为核心，顺利获得科研规划、严格审批、规范实施和长效管护，实现耕地保护、生态修复与乡村振兴的协同推进。具体实施中需结合地方资源禀赋和政策要求，灵活调整实施路径，确保项目可持续性。